Concernant le choix "EP et/ou remise à machine", je pense qu'il n'est pas nécessaire d'imaginer une annexe traction ou quelque chose de ce genre pour justifier la 2°voie car il existe bon nombre d'EP à plusieurs voies.
Tout dépend de l'importance et de la nature de l'entreprise embranchée. Les EP comportent une zone dite "2° partie de l'embranchement" où l'entreprise est chez elle, elle peut y effectuer des manœuvres avec un locotracteur (par exemple type "kof") ou autre engin rail-route.
Si l'entreprise est une petite usine, ou un silo d'une certaine importance, on peut imaginer une voie pour recevoir les wagons et les décharger (ou les charger au contraire), et une voie pour constituer au fur et à mesure la rame qui repartira vide (ou pleine) avec la prochaine desserte.